1922年
全国の主要な港湾関係者200名が出席し、大連港湾会議開催（中国・大連）。
“港湾協会”の設立を提案・決議。内務省に事務局が設置され、約100年にわたって活動してきた団体です。

2005年4月
港湾政策研究への効果的かつ迅速な取り組みを強化し、政策提言機能を強化するため、事務局内に「港湾政策研究所」を設置

2006年6月
「港湾政策研究所」を事務局より独立した組織として設立

2013年4月
公益社団法人日本港湾協会へ移行